解开海祇岛最核心的前提是完成稻妻地区对应的主线任务序列，只有推进魔神任务剧情才能开始前往这片区域的海上航线和地图传送功能。你需要完成魔神任务第二章·第一幕不动鸣神，恒常乐土及其相关篇章，之后才能从稻妻主岛乘坐浪船或通过传送锚点正式抵达并解开海祇岛这片新区域。这是开始海祇岛全部后续寻觅和解谜内容的完全基础，未完成此主线任务则无法进入该岛屿。

成功登上海祇岛后，若想解开岛上著名的水月池秘境，则需要完成一系列连贯的机关解谜。首先前往秘境所在位置，找到并参拜附近的基柱以获取雷种子。利用雷种子或自身附带的雷元素，去调整场景中出现的四个雷霆探针至正确的路线，当指针和底盘指示路线一致并出现紫色光圈时，保持静止直到指针固定，以此解封周围对应的四个雷元素方碑。点亮这四个雷元素方碑，此时秘境入口处的水位会下降一半。

水位下降后，跳入水中并游入显现出的洞口，一直游到尽头。从水道的尽头出来后，给右侧的墙体上方攀爬。在攀爬后的平台上，你可以找到墙上的三个机关，依次启动它们可以打开一道铁门。进入铁门后的洞口，继续给右侧墙体攀爬。你将找到壹个控制水位的总机关，启动它使水位完全退去，再打开最终出现的铁门，即可成功解开水月池秘境。

海祇岛上还分布着一些独立的全球任务，其中孤独的海兽任务和特定的尊像谜题紧密相关。这个任务的解谜决定因素流程其中一个，是标准玩家将鸣神大社的神樱等级提高至17级，否则无法穿梭任务区域的雷元素屏障。屏障解除后，需要按照特定路线移动并多次参拜尊像，才能最终完成该谜题。这属于在岛屿解开后，对玩家寻觅进度进一步标准。

岛上还存在一些不严格依赖任务接取的独立解谜挑战，例如一种基于数字和路线的九宫格谜题。这种谜题通常需要先阅读附近学者遗留的笔记获取提示，领会路线和数字的对应关系。解谜的核心制度是调整石碑的路线，使特定区域内横竖路线的数字之和满足固定条件。这类谜题散布在岛屿各处，完成它们可以获取宝箱奖励，是寻觅海祇岛时会遇到的环境挑战。